本所訂定之教育目標為：
「培養民族音樂學術研究、傳承、展演及教育之人才，兼具國際視野，掌握數位科技媒材，創新傳統音樂文化」，並對應此教育目標，衍生出以下四層面的核心能力：
壹、知識與認知層面
1. 音樂展演技術
2. 理論知識與獨立學術研究能力
3. 具備多媒體發展趨勢應用價值
貳、職能導向層面
1. 建立研究傳承與教學的應用方式
2. 音樂理論、分析、風格之專題研究
3. 獨立進行數位典藏、媒體實驗創作等相關工作
參、個人特質層面
1. 尊重不同音樂藝術形式
2. 自我表現/協調合作的能力
3. 接納傳統，尊重創作，吸收新知
肆、價值與倫理層面
1. 尊重音樂創作及智慧財產權
2. 維護傳統音樂藝術性之原貌，再現其價值與精華
3. 透過音樂能量豐富社會價值
核心能力為總體學習成果，亦是學習目標。透過課程規劃，依照課程架構修習本所課程，除共同必修及分組必修外，選修課程可分屬以下四類：「音樂本體」、「音樂文史」以及「音樂多媒體」，皆配合核心能力發展，相輔相成。
